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通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。
细胞壁结构。大肠杆菌的细胞壁是由多层的薄壁和厚壁组成的,其中薄壁含有较少的N-乙酰葡萄糖胺(NAG)和N-乙酰半乳糖胺(NAM),而厚壁则富含这两种物质,这种结构使得细胞壁难以被裂解,从而影响了质粒的提取。
最常用的办法是SDS法,在反应体系中加入终浓度约为1%的SDS37度水浴1小时就可以完成大肠杆菌的裂解。现在手提细菌的基因组DNA基本上就是这个办法,具体步骤在分子克隆和精编分子生物学实验指南上都有,是最经典的方法。SDS是一种阴离子去垢剂,能够破坏细菌的细胞壁和细胞膜。
毒性蛋白表达。这种情况很少出现,就是你转化进去的质粒有毒性蛋白的表达,这样就会出现不能大量培养,长到一定程度就会自溶。
要通过碱裂解法抽提质粒DNA,首先从大肠杆菌中分离质粒是常用方法。以下是详细的步骤准备和试剂准备: 原理:使用EDTA和SDS来处理细胞,EDTA破坏细胞壁并抑制DNA酶,SDS则溶解脂质和细胞膜,使蛋白质变性。通过调节pH值,使染色体DNA、质粒DNA变性,而质粒因其小体积特性,在pH降低后保持溶解状态。
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